Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LGI1-201ENST00000371413 1247 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
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DDB1Q16531 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 BRDTP1-201ENST00000605735 677 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 LINC02328-203ENST00000557195 682 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 MIR4644-201ENST00000579929 84 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
DDB1Q16531 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
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