Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SSR1-202ENST00000397511 3248 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AP001642.1-201ENST00000624727 2117 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 ZFRP1-201ENST00000457579 2970 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC040958.1-201ENST00000561102 201 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC006971.1-201ENST00000407916 4486 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 ST7-221ENST00000465133 2155 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.193-201ENST00000363979 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RN7SL517P-201ENST00000462240 305 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU4-77P-201ENST00000516692 156 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 ARHGEF38-202ENST00000420470 5454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
CCDC85BQ15834 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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