Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 MS4A1-207ENST00000532073 2560 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
CCINQ13939 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 MFAP1-201ENST00000267812 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 ANKRD36C-201ENST00000295246 2272 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 GHR-209ENST00000612626 4524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL079342.1-201ENST00000401460 267 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 OR2L3-201ENST00000359959 2792 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 EMSY-204ENST00000524490 4015 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
CCINQ13939 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 TMSB4XP3-201ENST00000445144 114 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RN7SL41P-201ENST00000476144 297 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNU1-6P-201ENST00000516290 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
CCINQ13939 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCINQ13939 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCINQ13939 DCDC1-211ENST00000597505 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCINQ13939 ZNF418-205ENST00000595830 3543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCINQ13939 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
CCINQ13939 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
CCINQ13939 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.9 ms