Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC072052.1-201ENST00000496556 306 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 KMO-202ENST00000366557 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC139769.2-201ENST00000599944 2291 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SNORA17.1-201ENST00000362945 126 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RN7SKP216-201ENST00000411050 312 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC068870.2-201ENST00000620635 389 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SPTY2D1-AS1-204ENST00000634992 373 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 LINC00504-201ENST00000505089 4672 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL590609.3-201ENST00000411815 210 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC009554.1-201ENST00000559251 399 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SESN1-201ENST00000302071 2718 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 EBF1-211ENST00000622875 4430 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
PTGDRQ13258 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms