Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 LINC02526-201ENST00000424162 419 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 FCF1P8-201ENST00000510322 597 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL121821.1-201ENST00000557067 530 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC024619.4-201ENST00000580924 316 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-510P-201ENST00000391239 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU1-45P-201ENST00000517191 141 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 LINC00907-211ENST00000601948 795 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms