Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 MIR548O-201ENST00000408583 114 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MYL6P3-201ENST00000436904 432 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 PPP1R11P1-201ENST00000486095 376 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AL589743.6-201ENST00000611025 117 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ERC2-214ENST00000612797 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 DTNA-204ENST00000348997 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 EZH1-201ENST00000415827 4608 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AGL-201ENST00000294724 7446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 LINC01252-201ENST00000499291 3673 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ARL17A-202ENST00000336125 3945 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 FCF1-201ENST00000341162 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ZNF229-204ENST00000614049 4507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 GALK2-201ENST00000327171 5299 ntTSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 DUSP19-202ENST00000354221 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 DHX57-203ENST00000457308 4859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 TEK-201ENST00000380036 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 GPBP1-203ENST00000424459 4683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 THAP9-201ENST00000302236 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AL596244.1-201ENST00000567068 3779 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 FBXW10-203ENST00000395665 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 LINC02073-201ENST00000588341 2845 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 NRCAM-205ENST00000413765 6406 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RNU6-1094P-201ENST00000362416 104 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RNA5SP333-201ENST00000363466 118 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RNA5SP334-201ENST00000364825 118 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 SPATA13-AS1-201ENST00000430733 433 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AL442224.1-201ENST00000443771 391 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RNA5SP362-201ENST00000516048 118 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AP003037.1-201ENST00000537594 267 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ERI2-206ENST00000563117 2903 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ABCA9-201ENST00000340001 6514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 CNKSR3-205ENST00000607772 21063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MED28-201ENST00000237380 10868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 GPM6B-205ENST00000454189 3957 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 LDAH-208ENST00000435420 3837 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 BTLA-201ENST00000334529 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ZNF292-202ENST00000369577 10610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 TTLL5-217ENST00000556893 3071 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 NPIPB5-205ENST00000424340 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AHI1-204ENST00000367800 5921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ARPP21-201ENST00000187397 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC116366.3-205ENST00000640655 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC021092.1-201ENST00000592946 3199 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RPL37-204ENST00000508493 553 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ZNF519P4-201ENST00000514008 125 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 PPFIA2-219ENST00000550359 3808 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AKAP6-213ENST00000557354 5259 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 NXF4-201ENST00000360035 3617 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ZNF521-214ENST00000584787 4327 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MAPK10-272ENST00000641110 2724 ntAPPRIS P2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 PIK3R3-202ENST00000372006 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MEF2C-225ENST00000625585 3467 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 IL5RA-204ENST00000418488 5521 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ALPK1-201ENST00000177648 4537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 DDX21-201ENST00000354185 4711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 RND3-202ENST00000375734 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 AMOT-206ENST00000524145 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MFSD8-201ENST00000296468 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 THADA-204ENST00000403856 6939 ntTSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 KIDINS220-206ENST00000473731 7248 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MYOZ2-201ENST00000307128 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 MYBPC1-203ENST00000392934 3644 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 ZBTB25-204ENST00000608382 10372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 METTL8-201ENST00000375258 8203 ntTSL 5 BASIC6.86□□□□□ -1.31
HOXD11P31277 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC6.86□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 195.6 ms