Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTD8

RBM42, RNA-binding protein 42, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM42Q9BTD8 REREP2Y-201ENST00000439103 200 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AL390726.5-202ENST00000564800 256 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 NBPF20-205ENST00000622803 3689 ntTSL 5 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 OR52B5P-204ENST00000641744 3467 ntBASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.3□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 TBCK-205ENST00000432496 3362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AL353784.1-201ENST00000422842 2300 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 TRAJ58-201ENST00000390481 63 ntAPPRIS P1 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.625-201ENST00000411256 107 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AL590762.4-201ENST00000425885 253 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AL160271.1-201ENST00000444708 829 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AC091564.3-201ENST00000527398 429 ntTSL 3 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 RN7SL708P-201ENST00000580952 299 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 CTNND1-214ENST00000526772 4966 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 RPE65-201ENST00000262340 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 DDX58-201ENST00000379868 4089 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 MIR130A-201ENST00000385274 89 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 RN7SKP213-201ENST00000410746 298 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 RPL7AP6-201ENST00000477943 801 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 LRRC49-204ENST00000544974 6605 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 IL33-202ENST00000417746 2327 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 CPS1-IT1-201ENST00000628368 2306 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
RBM42Q9BTD8 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AL137141.1-201ENST00000624622 4836 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RPL21P67-201ENST00000402896 478 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AL391219.1-201ENST00000422570 483 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RPS23P2-201ENST00000463671 415 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LINC02508-201ENST00000504165 426 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 RNASEL-202ENST00000539397 4046 ntTSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 LEPROT-206ENST00000613538 4625 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
RBM42Q9BTD8 PCDH15-202ENST00000361849 7017 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
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