Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 ATP6V1G1P2-201ENST00000522436 346 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL590560.1-203ENST00000544342 408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC011767.1-203ENST00000559762 529 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RN7SL457P-201ENST00000578760 287 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC092175.1-201ENST00000605325 200 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CR769775.3-201ENST00000610388 219 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MIR7113-201ENST00000621222 59 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SMCR2_1.1-201ENST00000621493 157 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 OGDH-210ENST00000631326 4116 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC24A4-201ENST00000393265 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF845-202ENST00000595091 4413 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GABRA1-204ENST00000437025 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NAIP-204ENST00000503719 5347 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 VWA5A-205ENST00000456829 4388 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GON4L-217ENST00000615926 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PPFIA2-211ENST00000548586 4033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MCM3-201ENST00000229854 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AP3B1-201ENST00000255194 5838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RGSL1-201ENST00000294854 3696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ICK-201ENST00000350082 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC097637.1-201ENST00000494383 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TMPPE-201ENST00000342462 3962 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NTNG2-201ENST00000372179 3984 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A6-203ENST00000358747 2729 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 VWCE-208ENST00000613271 3032 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CYP3A5-202ENST00000339843 3320 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ARHGEF34P-201ENST00000483587 4532 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TNPO3-205ENST00000627585 4514 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP4K4-201ENST00000302217 6624 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SPATA31E1-201ENST00000325643 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 DDHD1-203ENST00000395606 12769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SEMA6D-203ENST00000355997 5908 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 POU6F2-207ENST00000518318 5925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC023300.3-201ENST00000623096 5025 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TMTC1-201ENST00000256062 8805 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 BMPR1B-208ENST00000515059 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SNCAIP-201ENST00000261367 4986 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ELP3-201ENST00000256398 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS20-202ENST00000395541 4633 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ADAMTS20-204ENST00000553158 4633 ntTSL 5 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NLRP1-204ENST00000354411 4332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC105429.1-201ENST00000612833 4001 ntBASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PGK1-201ENST00000373316 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 EVL-203ENST00000544450 3704 ntTSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GCSAML-211ENST00000623578 3959 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K7-205ENST00000369332 4830 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GOLGA1-202ENST00000373555 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 WWP2-213ENST00000568684 3672 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 PPP6R3-202ENST00000265637 4783 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS9-211ENST00000521022 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SCYL2-211ENST00000635101 3948 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB27B-201ENST00000262094 7281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 EGF-204ENST00000503392 3642 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 AC026362.2-201ENST00000624878 5566 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RASGRP3-201ENST00000402538 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 INTS9-201ENST00000416984 2759 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NOP2-223ENST00000620535 2791 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZRANB3-210ENST00000536680 6943 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CR2-203ENST00000367059 3877 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SYNPO2L-201ENST00000372873 4121 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 TACC2-226ENST00000513429 4114 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 VCL-201ENST00000211998 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GGA2-201ENST00000309859 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ANO4-201ENST00000392977 3509 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CYB561A3-202ENST00000426130 3205 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MBTD1-203ENST00000415868 5099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC22A6-201ENST00000360421 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CR2-201ENST00000367057 4240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 NHSL2-207ENST00000633930 13660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 GAB3-202ENST00000369575 4718 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RAPGEF6-208ENST00000509018 8357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 CIZ1-205ENST00000372948 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 RIPOR2-201ENST00000259698 5471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF83-211ENST00000597597 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
KRTAP4-12Q9BQ66 MOBP-201ENST00000311042 3388 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 154.6 ms