Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 MALAT1-206ENST00000612781 234 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL356432.3-201ENST00000568952 465 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 CERS6-AS1-209ENST00000609766 642 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC113167.1-201ENST00000512941 570 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 FRG1KP-201ENST00000623592 341 ntBASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.48□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 RNU6-878P-201ENST00000384578 110 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC3.47□□□□□ -1.85
MEIS3Q99687 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms