Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 PCED1B-AS1-208ENST00000551898 359 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 CLMN-206ENST00000556441 452 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ZNF850-203ENST00000614887 7625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RPL19P16-201ENST00000433839 588 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC026464.3-201ENST00000563634 564 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 PEX2-201ENST00000357039 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
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PTPRNQ16849 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 ARHGAP18-201ENST00000368149 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
PTPRNQ16849 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.3□□□□□ -1.56
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