Protein–RNA interactions for Protein: Q16625

OCLN, Occludin, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCLNQ16625 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 FLJ27354-202ENST00000443562 770 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RN7SL727P-201ENST00000482164 296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 SSX4B-201ENST00000595235 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 SSX4-201ENST00000595689 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 Z98949.1-203ENST00000597284 851 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 MIR99AHG-219ENST00000619222 3476 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 SEC31A-209ENST00000500777 3610 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RNU6-898P-201ENST00000365627 104 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 TRAJ4-201ENST00000390533 63 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 BTF3P6-201ENST00000448054 499 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 H3F3AP1-201ENST00000559984 334 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 MED23-203ENST00000368058 4576 ntTSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 HERC1-201ENST00000443617 15137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 MIR375-201ENST00000362103 64 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 S100A11P1-201ENST00000477525 312 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 SNORA70.20-201ENST00000516848 126 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 IGBP1P1-201ENST00000554337 1009 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 GRIK2-201ENST00000318991 4317 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC4.78□□□□□ -1.64
OCLNQ16625 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.2 ms