Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 AC092470.1-201ENST00000546187 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
PSME4Q14997 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 LINC01077-201ENST00000452288 413 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC003009.1-201ENST00000571611 686 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 DPRXP5-201ENST00000604662 539 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 Z80107.1-201ENST00000436830 412 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 LINC02270-201ENST00000505386 610 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC010226.1-203ENST00000515570 765 ntTSL 2 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AL590410.1-201ENST00000617925 333 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 OTUD4-208ENST00000509620 864 ntTSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 FAM60CP-201ENST00000591086 664 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC135279.1-201ENST00000543493 504 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.18□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
PSME4Q14997 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
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