Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC010401.1-201ENST00000463867 348 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC004542.2-201ENST00000602847 546 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 Y_RNA.184-201ENST00000363884 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 RPS27P29-201ENST00000463110 252 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 SCARNA14-201ENST00000516903 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
RBM39Q14498 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121 ms