Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CD200R1-204ENST00000471858 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SPATA1-206ENST00000490879 2888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 FTX-210ENST00000603037 8347 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 FAM49B-212ENST00000519110 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 TMEM106C-220ENST00000552561 810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SMCR2_2.1-201ENST00000619783 161 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AP005019.3-201ENST00000620418 560 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 FILIP1-201ENST00000237172 4580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ZMYND11-217ENST00000627286 3914 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SF3B1-202ENST00000409915 600 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNA5SP519-201ENST00000516480 119 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MIR4433B-201ENST00000581329 102 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 PARP8-201ENST00000281631 7177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 AC108022.1-201ENST00000493466 478 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
COL9A3Q14050 ENSA-211ENST00000503345 793 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
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