Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 SNORD56.3-201ENST00000363507 71 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RN7SKP123-201ENST00000410732 291 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 UPP2-IT1-201ENST00000439185 357 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ANKRD7-204ENST00000477532 744 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC008498.1-201ENST00000613012 531 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 GACAT1-202ENST00000441383 540 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 DLEU2_1.2-201ENST00000614667 120 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC007318.2-201ENST00000620999 243 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SGCGQ13326 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205.1 ms