Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC092120.1-201ENST00000562211 420 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.26□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MS4A4E-201ENST00000398984 479 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RPL21P23-201ENST00000446654 460 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNA5SP503-201ENST00000517047 117 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC108449.1-202ENST00000517632 478 ntTSL 3 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC068657.1-201ENST00000520807 306 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.25□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 HMGB3P11-201ENST00000440127 604 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC104027.1-201ENST00000521887 300 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
TRAF3Q13114 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms