Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 ZBTB38-201ENST00000321464 3588 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP43-201ENST00000516559 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SSX9-202ENST00000608568 580 ntTSL 4 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SLITRK4-202ENST00000356928 3074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 CCDC169-204ENST00000379864 5944 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC022893.1-201ENST00000517664 3549 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC008691.1-207ENST00000636819 4154 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 TRAV23DV6-201ENST00000390451 409 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
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HCN4Q9Y3Q4 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 MIR4472-2-201ENST00000582069 67 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 PCDH15-217ENST00000414778 9234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RIMS2-205ENST00000436393 4384 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SNORD50.1-201ENST00000362987 71 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 SNORD113.2-201ENST00000364166 89 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
HCN4Q9Y3Q4 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
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