Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC007527.1-202ENST00000543347 382 ntTSL 3 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC012314.7-201ENST00000619693 93 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC024940.1-206ENST00000632817 4299 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.78□□□□□ -1.64
CCDC85BQ15834 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TBCA-207ENST00000520039 157 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RPL7P50-201ENST00000600588 727 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC119674.1-207ENST00000641355 633 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 OR2H1-203ENST00000377136 3024 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC005592.1-201ENST00000566527 1640 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 LST1-207ENST00000376092 285 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
CCDC85BQ15834 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms