Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.47□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.85
NEDD9Q14511 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC093392.2-201ENST00000450682 337 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU6-445P-201ENST00000516949 107 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 NBDY-202ENST00000423617 543 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
NEDD9Q14511 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms