Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

Predictions only

Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AL513323.1-201ENST00000431862 1063 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 BNIP3P7-201ENST00000605641 516 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
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SHROOM2Q13796 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC010967.1-201ENST00000421575 489 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC025524.1-201ENST00000518489 606 ntTSL 4 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 PHF11-215ENST00000488958 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AGR3-202ENST00000402239 563 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 MIR936-201ENST00000401264 98 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AL162400.1-201ENST00000418091 359 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 RPL7P34-201ENST00000433316 712 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 AC005021.1-201ENST00000608730 355 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
SHROOM2Q13796 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 OR6C72P-201ENST00000451403 892 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 PCNAP1-201ENST00000505363 709 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AC091304.6-201ENST00000619761 202 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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SHROOM2Q13796 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
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SHROOM2Q13796 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
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SHROOM2Q13796 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
SHROOM2Q13796 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
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