Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 TRBV1-201ENST00000476502 284 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC090607.4-201ENST00000558192 369 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL589743.7-201ENST00000612637 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
RPA4Q13156 HIF1A-201ENST00000323441 3555 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.1 ms