Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 ANK3-202ENST00000355288 3811 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC027290.2-201ENST00000623210 18662 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 TEX41-205ENST00000431734 529 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL117341.1-201ENST00000437213 373 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 LUZP2-207ENST00000533227 5016 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 HMGB1P27-201ENST00000431429 603 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 H2AFZP5-201ENST00000446960 382 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL603839.1-201ENST00000453437 432 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNA5SP228-201ENST00000516232 133 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC068446.3-201ENST00000555285 382 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AL391358.1-201ENST00000605342 190 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SNCA-AS1-201ENST00000501215 2646 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SEC31A-237ENST00000513858 3687 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 SNORD74.4-201ENST00000364129 80 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHRNEQ04844 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms