Protein–RNA interactions for Protein: O43915

VEGFD, Vascular endothelial growth factor D, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VEGFDO43915 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC007151.1-201ENST00000572774 483 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL080284.1-201ENST00000434493 442 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 SNORD19.2-201ENST00000516978 73 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC044798.1-201ENST00000565146 418 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 VIM-AS1-201ENST00000437232 1351 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC099342.1-201ENST00000446399 1124 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AP003498.1-201ENST00000532530 347 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC091043.1-201ENST00000579830 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 MIR7515-201ENST00000637837 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
VEGFDO43915 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 160.7 ms