Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

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Length 911 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC007938.3-201ENST00000604965 623 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 ZNF534-204ENST00000433050 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 CLSPN-206ENST00000520551 4010 ntTSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC6.7□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC105914.2-201ENST00000507525 233 ntTSL 3 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL354984.3-201ENST00000604803 325 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC123912.5-201ENST00000605470 343 ntBASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC6.69□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU1-108P-201ENST00000362556 161 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RPL7P42-201ENST00000481005 679 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 DLEU1_1.1-201ENST00000618107 190 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 SCN2A-201ENST00000283256 8660 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 CSMD3-203ENST00000343508 13018 ntTSL 1 (best) BASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC6.68□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RN7SL176P-201ENST00000580352 264 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 LINC00993-204ENST00000606476 500 ntTSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 MIR8069-1-201ENST00000616627 86 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 MIR8069-2-201ENST00000621412 86 ntBASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 WDR7-201ENST00000254442 14083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC6.67□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC6.66□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.66□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
BCANQ96GW7 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC6.66□□□□□ -1.34
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