Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU7-63P-201ENST00000459054 62 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AC053481.3-201ENST00000577881 843 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 ARAP2-210ENST00000618163 2592 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
CCDC142Q17RM4 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC127526.1-201ENST00000417526 366 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC079354.3-201ENST00000447111 311 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC034236.1-201ENST00000469891 373 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CYP2C61P-201ENST00000604072 290 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 CNGB3-201ENST00000320005 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LINC00427-201ENST00000412722 430 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC142Q17RM4 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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