Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 LINC01894-201ENST00000580984 487 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 MT-TL1-201ENST00000386347 75 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
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CCDC6Q16204 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 LINC01780-201ENST00000420059 442 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CCDC6Q16204 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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