Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AP003400.6-201ENST00000624698 740 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 SNAPC3-201ENST00000380799 753 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AL512504.1-201ENST00000415494 778 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 LINC01065-201ENST00000417989 577 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC068135.2-201ENST00000569293 1028 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AL049637.1-201ENST00000424664 503 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC025768.1-201ENST00000510057 267 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RPS15AP27-201ENST00000449183 343 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AP004607.1-201ENST00000524456 203 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AL590426.2-201ENST00000607287 786 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
NCOA1Q15788 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.3 ms