Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AL008987.1-201ENST00000415528 237 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 MTND1P32-201ENST00000433043 938 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 IAPP-204ENST00000539393 409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC068993.2-201ENST00000546563 395 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 ATXN3L-201ENST00000380622 2164 ntAPPRIS P1 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 FGF12-AS1-201ENST00000414920 580 ntTSL 4 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC008850.1-201ENST00000427546 362 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AP001372.4-201ENST00000524889 472 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.43□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AL356596.1-201ENST00000624230 379 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.42□□□□□ -2.02
CYTH1Q15438 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.42□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms