Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRRQ15256 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRRQ15256 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRRQ15256 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRRQ15256 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
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PTPRRQ15256 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
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PTPRRQ15256 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 TMEM67-202ENST00000409623 3255 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
PTPRRQ15256 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
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