Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL139418.1-201ENST00000613613 177 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU6-777P-201ENST00000364265 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MTND1P21-201ENST00000412991 285 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MTCO2P21-201ENST00000419780 677 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 ANKRD26P4-201ENST00000455755 950 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC105185.1-201ENST00000518705 535 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LINC01674-201ENST00000427446 504 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC022360.2-201ENST00000522390 456 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC022022.2-201ENST00000602989 360 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 CXADR-203ENST00000400165 603 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SMC1AQ14683 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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