Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC008962.1-201ENST00000605729 304 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 CALN1-204ENST00000405452 8571 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MYO5A-201ENST00000356338 11971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC110023.1-201ENST00000554318 457 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 FAM111A-201ENST00000361723 3592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC5.15□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 KCNC4-201ENST00000369787 18750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.58
COL9A3Q14050 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SDHCP2-201ENST00000398565 501 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 FRMPD3-AS1-201ENST00000415252 457 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL356387.2-201ENST00000422272 243 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC011396.2-202ENST00000511390 375 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SSH2-201ENST00000269033 9327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.15□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SDR42E1-201ENST00000328945 11566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
COL9A3Q14050 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.14□□□□□ -1.59
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