Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 AC091152.2-201ENST00000591628 2569 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
SP140Q13342 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
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SP140Q13342 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
SP140Q13342 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
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SP140Q13342 GNRHR2P1-201ENST00000555315 631 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SP140Q13342 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SP140Q13342 AC022893.3-201ENST00000607665 437 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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