Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 AC104653.1-201ENST00000420579 578 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 BX005214.1-201ENST00000427327 476 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL606662.1-201ENST00000445763 553 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPS3AP14-201ENST00000483907 780 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 CNOT1-223ENST00000628857 291 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL512658.1-201ENST00000449072 533 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC098591.2-201ENST00000510152 315 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 COMMD8-201ENST00000381571 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 ZRANB2-AS2-201ENST00000411721 518 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC110296.1-201ENST00000515680 341 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
RPA4Q13156 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.8 ms