Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 RNU6-146P-201ENST00000384602 108 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC110792.1-201ENST00000491826 472 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-840P-201ENST00000517275 65 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR99AHG-211ENST00000602323 475 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 DDX20-202ENST00000475700 4332 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SDCBP-213ENST00000630925 2076 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL137076.1-201ENST00000441046 551 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC092138.1-201ENST00000568659 472 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CASP1-217ENST00000640184 327 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 AC104662.3-202ENST00000507794 4055 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CENPE-202ENST00000380026 8241 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHRNEQ04844 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms