Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X2

PIAS3, E3 SUMO-protein ligase PIAS3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIAS3Q9Y6X2 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIAS3Q9Y6X2 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PIAS3Q9Y6X2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIAS3Q9Y6X2 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIAS3Q9Y6X2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIAS3Q9Y6X2 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIAS3Q9Y6X2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIAS3Q9Y6X2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIAS3Q9Y6X2 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PIAS3Q9Y6X2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIAS3Q9Y6X2 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms