Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW5

AGTPBP1, Cytosolic carboxypeptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGTPBP1Q9UPW5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
AGTPBP1Q9UPW5 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
AGTPBP1Q9UPW5 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms