Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SORCS3Q9UPU3 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SORCS3Q9UPU3 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms