Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ7

PDZRN3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZRN3Q9UPQ7 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN3Q9UPQ7 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN3Q9UPQ7 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN3Q9UPQ7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN3Q9UPQ7 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN3Q9UPQ7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN3Q9UPQ7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PDZRN3Q9UPQ7 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PDZRN3Q9UPQ7 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms