Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJJ7

RPUSD1, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD1Q9UJJ7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RPUSD1Q9UJJ7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
RPUSD1Q9UJJ7 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms