Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CHORDC1Q9UHD1 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CHORDC1Q9UHD1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms