Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEE9

CFDP1, Craniofacial development protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFDP1Q9UEE9 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CFDP1Q9UEE9 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CFDP1Q9UEE9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms