Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SPASTQ9UBP0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SPASTQ9UBP0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms