Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K1

CC2D2A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D2AQ9P2K1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
CC2D2AQ9P2K1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC34.26■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC34.25■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
CC2D2AQ9P2K1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms