Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RRBP1Q9P2E9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
RRBP1Q9P2E9 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms