Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J7

KCMF1, E3 ubiquitin-protein ligase KCMF1, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCMF1Q9P0J7 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
KCMF1Q9P0J7 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.9 ms