Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GDE1Q9NZC3 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GDE1Q9NZC3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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