Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMC4Q9NTJ3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMC4Q9NTJ3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms