Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
RRP7BPQ9NSQ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
RRP7BPQ9NSQ0 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms