Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
DUOX1Q9NRD9 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms