Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR81

ARHGEF3, Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3Q9NR81 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
ARHGEF3Q9NR81 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
ARHGEF3Q9NR81 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms